Tha iomadh seòrsa de peptides transmembrane ann, agus tha an seòrsachadh stèidhichte air feartan fiosaigeach is ceimigeach, stòran, dòighean slugaidh, agus tagraidhean bith-mheidigeach.A rèir an cuid feartan fiosaigeach agus ceimigeach, faodar peptides a tha a 'dol a-steach do membran a roinn ann an trì seòrsaichean: cationic, amphiphilic agus hydrophobic.Tha peptides treòrachaidh membran cationic agus amphiphilic a’ dèanamh suas 85%, fhad ‘s a tha peptides a tha a’ dol a-steach le membran hydrophobic a ’dèanamh suas dìreach 15%.
1. Cationic membran penetrating peptide
Tha peptides transmembrane cationic air an dèanamh suas de pheptidean goirid a tha beairteach ann an arginine, lysine, agus histidine, leithid TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 agus DPV6.Nam measg, tha guanidine ann an arginine, a dh’ fhaodas ceangal hydrogen le buidhnean searbhag fosphoric le droch chasaid air an membran cealla agus peptides transmembrane a mheadhanachadh a-steach don membran fo chumha luach PH fios-eòlasach.Sheall sgrùdaidhean air oligarginine (bho 3 R gu 12 R) nach deach an comas treòrachaidh membran a choileanadh ach nuair a bha an ìre de arginine cho ìosal ri 8, agus mheudaich comas treòrachaidh membran mean air mhean leis an àrdachadh anns an ìre de arginine.Chan eil guanidine ann an Lysine, ged a tha e cationic mar arginine, agus mar sin nuair a tha e ann leis fhèin, chan eil èifeachdas treòrachaidh membran glè àrd.Futaki et al.(2001) lorg nach gabhadh deagh bhuaidh dol-a-steach membran a choileanadh ach nuair a bha co-dhiù 8 amino-aigéid le uallach dearbhach anns a’ peptide cationic cealla a bha a’ dol a-steach.Ged a tha fuigheall aminoideach le cosgais dearbhach riatanach airson peptidean treòrachail a dhol a-steach don membran, tha amino-aigéid eile a cheart cho cudromach, leithid nuair a bhios W14 a’ gluasad gu F, tha penetrability Penetratin air a chall.
Is e clas sònraichte de pheptidean transmembrane cationic sreathan sgìreachadh niùclasach (NLSn), anns a bheil peptides goirid a tha beairteach ann an arginine, lysine agus proline agus faodar an giùlan chun niuclas tron ionad pore niùclasach.Faodar NLSn a roinn tuilleadh ann an clò-sgrìobhadh singilte agus dùbailte, anns a bheil aon agus dà bhuidheann de amino-aigéid bunaiteach, fa leth.Mar eisimpleir, tha PKKKRKV bho bhìoras simian 40 (SV40) na aon taidhpeadh NLS, fhad ‘s a tha pròtain niùclasach na NLS a’ taipeadh dùbailte.Is e KRPAATKKAGQAKKKL an t-sreath ghoirid as urrainn pàirt a ghabhail ann an transmembrane membran.Leis gu bheil àireamhan cosgais nas lugha na 8 aig a’ mhòr-chuid de NLSn, chan e peptides transmembrane èifeachdach a th’ ann an NLSn, ach faodaidh iad a bhith nan peptidean transmembrane èifeachdach nuair a tha iad ceangailte gu covalently ri sreathan peptide hydrophobic gus peptides transmembrane amphiphilic a chruthachadh.
2. Amphiphilic transmembrane peptide
Tha peptides transmembrane amphiphilic air a dhèanamh suas de raointean hydrophilic agus hydrophobic, a dh’ fhaodar a roinn ann am prìomh amphiphilic, àrd-sgoile α-helical amphiphilic, amphiphilic fillte β agus amphiphilic beairteach le prolin.
Peptidean membran caitheamh amphiphilic de sheòrsa bun-sgoile ann an dà roinn, roinn le NLSn ceangailte gu co-fhreagarrach le sreath peptide hydrophobic, leithid MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) agus Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Tha an dà chuid stèidhichte air a’ chomharra ionadail niuclasach PKKKRKV anns an SV40, Tha fearann MPG co-cheangailte ris an t-sreath fusion de HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), agus tha an raon hydrophobic de Pep-1 co-cheangailte ris a’ bhuidheann beairteach tryptophan le dàimh àrd membran (KETWWET WWTEW).Ach, tha raointean hydrophobic an dà chuid ceangailte ri comharra sgìreachadh niùclasach PKKKRKV tro WSQP.Chaidh clas eile de pheptidean transmembrane amphiphilic bun-sgoile a sgaradh bho phròtainean nàdarra, leithid pVEC, ARF (1-22) agus BPrPr (1-28).
Bidh na peptides transmembrane amphiphilic àrd-sgoile α-helical a’ ceangal ris an membran tro α-helices, agus tha na fuigheall aminoidid hydrophilic agus hydrophobic aca suidhichte air diofar uachdar den structar helical, leithid MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Airson membran caitheamh amphiphilic seòrsa fillte beta peptide, tha a chomas air duilleag beta pleated a chruthachadh deatamach airson comas treòrachaidh an membran, leithid ann an VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) ann a bhith a’ sgrùdadh comas treòrachaidh an membran, a’ cleachdadh an seòrsa D. - cha b’ urrainn do analogues mutation amino acid pìos beta fillte a chruthachadh, tha comas dol a-steach na membran gu math bochd.Ann am peptides transmembrane amphiphilic le beairteas proline, tha polyproline II (PPII) air a chruthachadh gu furasta ann an uisge fìor-ghlan nuair a tha proline air a bheairteachadh gu mòr anns an structar polypeptide.Tha PPII na helix air an làimh chlì le 3.0 fuigheall aminoideach gach cas, an taca ris an structar àbhaisteach alpha-helix air an làimh dheis le fuigheall aminoideach 3.6 gach cas.Bha peptides transmembrane amphiphilic beairteach le proline a’ toirt a-steach peptide antimicrobial bovine 7 (Bac7), polypeptide synthetigeach (PPR) n (n faodaidh e a bhith 3, 4, 5 agus 6), msaa.
3. Hydrophobic membran penetrating peptide
Chan eil ann am peptides transmembrane hydrophobic ach fuigheall aminoideach neo-polar, le cosgais lom nas lugha na 20% de chosgais iomlan an t-sreath aminoideach, no tha moieties hydrophobic no buidhnean ceimigeach ann a tha riatanach airson transmembrane.Ged a thathas gu tric a’ cumail sùil air na peptidean transmembrane ceallach seo, tha iad ann, leithid factar fàis fibroblast (K-FGF) agus factar fàis fibroblast 12 (F-GF12) bho sarcoma Kaposi.
Ùine puist: Mar-19-2023